Информационная система «Рецепт-М» предназначена для автоматизации работы аптечного учреждения и обеспечивает оперативный складской учет лекарственных средств с учетом их серий, цен, сроков годности, атрибутов поставки, источников финансирования, а так же  обеспечивает автоматизацию накопления данных о выписанных лекарственных средствах гражданам, относящимся  к региональному сегменту федерального регистра лиц, имеющих право на государственную социальную помощь. Программный комплекс «Рецепт-М» позволяет вести как простой учет на одном складе, так и сложный с несколькими пунктами отпуска.
Информационная система «Рецепт-М» обеспечивает:

• ведение складского учета ЛС: приход и списание ЛС, возврат поставщику, передачу в другие аптечные пункты,  реализацию ЛС по рецептам с разбивкой по видам финансирования (федеральный бюджет, местный, областной, собственные закупки, гуманитарная помощь);
• загрузку электронных накладных в различных форматах поставщиков;
• ведение ежемесячной и текущей отчетности по движению ЛС, а также формирование отчетности для муниципальных образований;
• формирование счетов на основе реестров, выставляемых к оплате ЛПУ;
• загрузку информации в базу данных регионального сегмента федерального регистра лиц, имеющих право на государственную социальную помощь на основе списков, предоставляемых Управлением социальной защиты населения;
• формирование ежемесячной отчетности для УСЗН  по выписанным рецептам;
• обмен данными с программным модулем «Диабет-регистр»;
• формирование сводной базы данных для рабочих мест, территориально удаленных друг от друга.

Информационная система «Рецепт-М» состоит из трех программных модулей: «Приход ЛС», «Реализация ЛС», «Учет и анализ ЛС» и обеспечивает автоматизацию полного цикла работ, связанных с лекарственными средствами в рамках учреждения.
Программный модуль «Приход ЛС» выполняет следующие основные технологические функции: приход лекарственных средств с учетом источника финансирования, ввод приходной накладной, списание ЛС по цене реализации, возврат товара поставщику по цене прихода, внутреннее перемещение, ведение картотеки ЛС, работа с остатками лекарственных средств и поставщиками.
Программный модуль «Реализация ЛС» предназначен для ввода рецептов с учетом источника финансирования и процента оплаты лекарственных средств льготником, осуществления операций с базой данных регионального сегмента федерального регистра лиц, имеющих право на государственную социальную помощь, работы с остатками ЛС, ведения системы отказов и и получения необходимой документации.
Программный модуль «Учет и анализ ЛС» предназначен для формирования ежемесячной и текущей отчетности.  Обеспечивает автоматизацию работы с картотекой ЛС, анализа остатков, работы с документацией, а также позволяет формировать отчетность по движению лекарственных средств.
В состав документации входят следующие виды отчетов: оборотная ведомость в приходных и розничных ценах, ведомость движения товаров, ведомость реализации товаров, ведомость по приходу, передаче, списанию и возврату.
В документацию для муниципальных образований входят отчеты поставщику (отчет об остатках, товарный отчет за период, отчет об отпущенных ЛС и т.д.), отчеты в ЛПУ (статистика реализации рецептов, акты сверки и др), оперативная информация (форма «Аптека Л1», статистика отпущенных медикаментов).
Одной  из функций программного модуля «Учет и анализ ЛС» является формирование и печать счетов-фактур по реестрам выписанных рецептов. Если счет-фактура формируется автоматически, в нее попадают все реестры рецептов по выбранному лечебно-профилактическому учреждению за текущий период. В случае, когда требуется по одному ЛПУ сформировать несколько счетов-фактур, выбирается ручной способ формирования, и пользователь может самостоятельно определить реестры попадающие в счет-фактуру.
Для организаций с территориально удаленными друг от друга пунктами разработан механизм выгрузки документооборота и загрузки его в сводную базу для итогового контроля и анализа.
Во всех модулях предусмотрена возможность работы одного оператора с несколькими пунктами отпуска.